Stejně jako v letech minulých posuzovala licenční komise žádosti dle podmínek stanovených v Licenčním manuálu FAČR. Rozhodnutí o licencích jsou následující: 

SK Dynamo České Budějovice – UDĚLENA 

FK BAUMIT Jablonec – UDĚLENA 

FC Hradec Králové – UDĚLENA 

FC Slovan Liberec – UDĚLENA 

FK Mladá Boleslav - UDĚLENA 

SK Sigma Olomouc – UDĚLENA 

FC Baník Ostrava – NEUDĚLENA 

FC Viktoria Plzeň – UDĚLENA 

AC Sparta Praha – UDĚLENA 

FK Dukla Praha – UDĚLENA 

SK Slavia Praha – UDĚLENA 

1.FK Příbram – UDĚLENA 

1.FC Slovácko – UDĚLENA 

FK Teplice – UDĚLENA 

FC Vysočina Jihlava – UDĚLENA 

FC Zbrojovka Brno - UDĚLENA 

Kluby, kterým nebyla licence udělena, se mohou odvolat do 21. 5. 2013 k Licenčnímu tribunálu FAČR (druhá instance). Po pečlivém zhodnocení celého případu, ohledně udělení licenci FAČR konkrétnímu klubu, přijme Licenční tribunál rozhodnutí, které bude konečné. 

Jediným klubem, který licenci neobdržel, je FC Baník Ostrava. Nesplnil tři podmínky: závazky po lhůtě splatnosti vůči fotbalovým klubům, závazky po lhůtě splatnosti vůči zaměstnancům, daňovým orgánům a orgánům sociálního zabezpečení a nedodržel schopnost pokračovat v činnosti jako zavedený podnik."Teď je na Baníku, aby v rámci odvolání prokázal, že nastaly nové skutečnosti, které mohou změnit stávající rozhodnutí," řekl licenční manažer Stanislav Rýznar.